ПАЛИНДРОМИ И ПОТЕНЦИЈАЛНЕ СЕКУНДАРНЕ СТРУКТУРЕ У ТРАНСКРИПТИМА ИЗОФОРМИ БИЉНИХ ГЛУТАМИН-СИНТЕТАЗА

Глутамин синтетаза (GS, E.C. 6.3.1.2) има централну улогу у метаболизму азота јерасимилује амонијак у глутамин. Биљке поседују једну хлоропластну (GS2) и једну или вишецитосолних (GS1) изоформи. Zea mays и Arabidopsis thaliana спадају у врсте са највећимфамилијама GS гена, јер поред једне GS2 имају по пет GS1 изоформи. Регулација експресије GSгена, као и регулација ензимске GS активности на посттранслационом нивоу много је проучавана.Међутим, готово да и нема информација о могућности посттранскрипционе регулације на нивоуGS транскрипата. Ми смо показали да GS мРНК могу да поприме стабилне секундарне структуреукоснице или хомо и хетеродимера у региону који претходи или укључује AUG кодон, што можеутицати на ефикасност транслације и на стабилност транскрипата. Могућност формирањаукосница заснива се на присуству палиндрома са размацима, док се димери могу формиратиуколико секвенце садрже палиндоме без размака. Свих шест транскрипата GS кукуруза, као и тритранскрипта A. thaliana имају по један палиндром од 6 nt без размака, док један транскрипт A.thaliana има два оваква палиндрома. Поред тога, GS1-3 кукуруза и GLN1;2 A. thaliana имају поједан перфектан палиндром од 8 nt са размаком. Како би се показао статистички значај овихналаза, број нађених палиндрома у GS транскриптима представљен је као однос броја нађених иброја очекиваних палиндрома свих дужина са и без размака у секвенцама датих дужина. Нашабиоинформатичка анализа сугерише да GS транскрипти поседују структурне елементе којиомогућавају регулацију на нивоу мРНК и представља добру полазну основу за експерименталнeстудије предложене посттранслационе регулације.