Open AccessGerência e Análises de Workflows aplicados a Redes Filogenéticas de Genomas de Dengue no Brasil
Author(s) -
Rafael Terra,
Micaella Coelho,
Lucas Cruz,
Marco Túlio Antônio García-Zapata,
Luiz Gadelha,
Carla Osthoff,
Diego Carvalho,
Kary Ocaña
Publication year - 2021
Language(s) - Portuguese
Resource type - Conference proceedings
DOI - 10.5753/bresci.2021.15788
Subject(s) - biology , humanities , philosophy
Processos evolutivos e dispersão de genomas de Dengue no Brasil são relevantes na direção do impacto e vigilância endemo-epidêmico e social de arboviroses emergentes. Árvores e redes filogenéticas permitem exibir eventos evolutivos e reticulados em vírus originados pela alta diversidade e taxa de mutação de recombinação homóloga frequente. Apresentamos um workflow científico paralelo e distribuído para redes filogenéticas desenhado para trabalhar com a diversidade de ferramentas e recursos em experimentos da biologia computacional e acoplados a ambientes de computação de alto desempenho. Apresentamos uma melhoria no tempo de execução de aproximadamente 5 vezes em comparação com a execução sequencial em análises de genomas de dengue e com identificação de eventos de recombinação.