Open AccessDiversidade de cepas de Stenotrophomonas maltophilia isoladas entre 1958 e 2021 e genotipadas por multilocus sequence typing
Author(s) -
Rebeca Vitória da Silva Lage,
Paula Vasconcelos Costa,
Luciana Veloso da Costa,
Maria Helena Simões Villas Bôas,
Marcelo Luiz Lima Brandão
Publication year - 2021
Publication title -
revista científica do centro universitário de barra mansa/revista científica do ubm
Language(s) - Portuguese
Resource type - Journals
eISSN - 2764-5185
pISSN - 1516-4071
DOI - 10.52397/rcubm.v23i45.1036
Subject(s) - multilocus sequence typing , biology , stenotrophomonas maltophilia , microbiology and biotechnology , genetics , genotype , gene , bacteria , pseudomonas aeruginosa
O objetivo deste estudo foi avaliar os dados in silico de cepas de S. maltophilia (n=974) caracterizadas por Multilocus Sequence Typing (MLST) disponíveis no banco PubMLST isoladas entre 1958 e 2020. As cepas com perfil alélico completo (n=972) foram analisadas utilizando a árvore filogenética neighbor-joining, a ferramenta minimum spanning tree e o algoritmo eBURST. O índice de Simpson foi aplicado para calcular o poder de resolução do MLST para tipificação. A maioria das cepas depositadas são de origem clínica (87,6%) e oriundas da Ásia (47,1%). As cepas de S. maltophilia apresentaram alta diversidade genética quando avaliadas, sendo identificadas em 679 ST distintos, uma taxa de ~1,4 cepa/ST. O índice de Simpson calculado foi de 0,99. O Brasil possui 10 cepas depositadas classificadas em sete ST distintos, sendo quatro isolados de infecções em humanos. Em conclusão, o MLST apresentou-se como uma ferramenta poderosa para investigações epidemiológicas de cepas de S. maltophilia.