Estimation of the Ki-67 Proliferation Marker Expression Level with Computer Vision Technology

В последнее время в качестве средств компьютерной диагностики широкую популярность приобретают элементы из области компьютерного зрения. Целью данной работы является разработка программных средств, позволяющих автоматически анализировать онкомаркированные клетки в образцах медицинских изображений. В процессе работы была решена такая задача, как выявление количества онкомаркированных клеток в образце медицинского изображения. Это стало возможно благодаря тесному взаимодействию с морфологами, обозначавшими интересующие их фрагменты снимка, где необходимо было произвести подсчет онкомаркированных клеток, и опыту программиста в решениях подобных задач других областей жизнедеятельности с помощью технологии компьютерного зрения. Медицинские изображения были размечены морфологами и представляли собой срез стекла, на котором были окрашены в определенный цвет онкомаркированные клетки специальным препаратом. Исследуемым органом стал язык. В результате был совершен подсчет иммунопозитивных клеток, что дает морфологам возможность наблюдать более объективную картину в изображении среза стекла образца, позволяющую скорректировать решение в отношении постановки диагноза и назначения необходимого лечения. Lately, computer vision technologies have become common computer diagnostics tools. The study objective is the development of software tools to automatically detect cells with proliferation markers on medical images. We managed to qualitatively assess the number of cells with proliferation markers on a medical image sample. We closely cooperated with morphologists who identified the areas of interest on the image where the cells with proliferation markers were to be counted. Another enabler was an extensive experience with developing computer vision systems for other applications. The medical images were tokenized by the morphologists. The images were slices where the proliferation marker cells were dyed. The organ under investigation was the tongue. We counted the immune-positive cells. It helped the morphologists to have some objective slice image metrics used to adjust the diagnosis and therapy plans.