Zegar molekularny w teorii i praktyce: przewodnik dla początkujących..

Koncepcja zegara molekularnego powstała ponad półwieku temu i od tamtej pory odegrała ważną rolę w badaniachbiologicznych, zajmujących się zarówno opisemprocesów ewolucyjnych, jak i szacowaniem wieku dywergencji.Zegar molekularny odmierza czas pomiędzy poszczególnymiwydarzeniami ewolucyjnymi, opierając sięna założonym modelu ewolucji (czyli tempie substytucji).Dziesiątki lat badań pokazały, że tempo ewolucji nie jestwartością uniwersalną dla wszystkich organizmów i zależyod szeregu czynników, takich jak: wielkość ciała,długość trwania cyklu życiowego czy tempo metabolizmu.Spowodowało to opracowanie wielu modeli zegaramolekularnego biorących pod uwagę zmienność tempawzdłuż gałęzi drzewa filogenetycznego. Ogromną rolę wodtwarzaniu filogenezy przy użyciu zegara molekularnegojako narzędzia, stanowi jego kalibracja. Istnieje kilkametod kalibracyjnych, których zastosowanie zależy oddostępności punktów kalibracyjnych dla badanej grupyorganizmów. Głównym celem artykułu jest zapoznanieczytelnika zarówno z teoretycznymi, jak i z praktycznymizagadnieniami dotyczącymi zegara molekularnego.