OBEPINE : une expérience française de suivi de l’épidémie de Covid-19 à travers les eaux usées

Le consortium de recherche Obépine (Observatoire Épidémiologique dans les Eaux Usées) s’est attaché, depuis mars 2020, à exploiter la présence du SARS-CoV-2 dans les eaux usées pour proposer un suivi épidémiologique de la COVID-19 en France. Bien que l’épidémiologie des eaux usées soit une discipline déjà ancienne, elle n’a jamais connu de déploiement aussi important à l’échelle nationale et internationale. Réunissant des équipes de recherche aux compétences variées, Obépine a établi les premiers protocoles de quantification du génome viral dans eaux usées des stations de traitement des eaux usées (STEU). Le réseau sentinelle qui a été construit avec l’appui du Ministère français de lʼEnseignement supérieur, de la Recherche et de lʼInnovation comprend à ce jour 200 STEU en France métropolitaine et outre-mer. Il permet d’évaluer de façon bihebdomadaire la dynamique de l’épidémie dans plus de 33 % de la population française. Cet article présente la genèse d’un projet de surveillance et les axes de recherche d’un réseau qui souhaite s’attacher - dans un futur proche – à compléter les dispositifs d’alerte précoce et de suivi des infections endémiques ou émergentes existants. Mots-clefs : SARS-CoV-2, COVID-19, épidémiologie dans les eaux usées, réseau sentinelle