Open AccessDiseño y evaluación de primers para el estudio de la expresión del gen PepT1 en células del epitelio intestinal de juveniles de tilapia (Oreochromis sp.) por RT-PCR
Author(s) -
Juan Manuel Vera Delgado
Publication year - 2014
Publication title -
la técnica/la técnica (en línea)
Language(s) - Spanish
Resource type - Journals
eISSN - 2477-8982
pISSN - 1390-6895
DOI - 10.33936/la_tecnica.v0i13.587
Subject(s) - tilapia , oreochromis , microbiology and biotechnology , biology , fish <actinopterygii> , humanities , fishery , philosophy
El péptido transportador 1 (PepT1) es una proteína de membrana que facilita la captación de di/tri péptidos en el intestino. Estudios funcionales y estructurales han proporcionado información detallada sobre las características del gen PepT1 y varios aspectos de su regulación en vertebrados superiores, sin embargo, la información en vertebrados inferiores, donde se incluyen los peces, es limitada. PepT1 juega una importante función en la absorción de oligopéptidos y por lo tanto en el crecimiento de los peces. Los resultados de alineación de secuencias, usando el programa ClustalW, mostraron que PepT1 en tilapia (Oreochromis sp.) consiste de 21 exones, cubriendo una región genómica de unos 8 938 nucleótidos; mientras, la región codificante corresponde a 2 274 nucleótidos. Diferentes primers fueron diseñados basados en las regiones más homólogas de los alineamientos ClustalW. Seis pares de cebadores fueron seleccionados para el experimento de RT-PCR y el ARN extrayéndolo del intestino de juveniles de tilapia. Los amplicones esperados se obtuvieron por cada par de cebadores, en virtud de diversas temperaturas de hibridación y tiempo de amplificación.
Palabras clave: PepT1; SLC15A1; tilapia; Oreochromis niloticus; primers; RT-PCR.