ГЕНОТИПИРОВАНИЕ ИЗОЛЯТОВ Е. COLI, ВЫРАЩЕННЫХ ИЗ БИОМАТЕРИАЛА ИНДЕЕК Терлецкий В.П., Тыщенко В.И., Новикова О.Б., Шинкаренко Л.А.

КЛЮЧЕВЫЕ СЛОВА: ПАТОГЕНЫ, ГЕНОТИПИРОВАНИЕ, БАКТЕРИАЛЬНЫЕ ШТАММЫ, ИЗОЛЯТЫ, E. COLI, ИНДЕЙКИАННОТАЦИЯ: Рассматриваются вопросы циркулирования у птиц патогенных микроорганизмов, подчеркивается важность их генотипирования с целью определения путей распространения инфекции и идентификации источника. В экспериментальной части работы представлены данные по возможным комбинациям ферментов рестрикции для генотипирования изолятов E. coli методом двойного расщепления и избирательного мечения (ДРИМ). Выбрана лучшая пара ферментов для генотипирования (XbaI/PstI); эта пара ферментов имеет один и тот же оптимальный буфер; таким образом, ферменты совместимы между собой при проведении одновременного расщепления геномной ДНК бактерий. Приведены сведения по теоретическому моделированию генотипирования in silico. Показано генетическое разнообразие патогена (идентифицировано 17 штаммов у 22 изолятов из биоматериала индеек), обсуждаются недостатки генотипирования с использованием праймеров ERIC. Представленные данные свидетельствуют о перспективности метода ДРИМ при генотипировании изолятов E. coli.