ОСОБЕННОСТИ РАСПРЕДЕЛЕНИЯ ГОМОЗИГОТНЫХ РАЙОНОВ В ГЕНОМЕ КУР Терлецкий В.П., Тыщенко В.И., Дементьева Н.В.

Использование чиповой технологии, выявляющей одновременно тысячи однонуклеотидных полиморфизмов (SNPs) в геноме кур, позволяет определить как генетические взаимоотношения между породами, так и прояснить происхождение птицы, оценить уровень генетического разнообразия и инбридинга в популяциях. Целью работы было показать возможности мультилокусного анализа количества и длины районов гомозиготности (ROH) для выявления генетических особенностей генома в четырех двухпородных гибридах кур. Для генотипирования использовали чипы Illumina Chicken 60K SNP BeadChip®. Расчеты проводились с помощью программного обеспечения PLINK 1.9 и EIGENSOFT 6.1.4. Было показано, что наибольшее число ROH детектировалось в геноме гибридов царскосельской породы и суссекс, что является, возможно, следствием отбора при селекции исходных пород. С другой стороны, наличие общих предков в исходных породах приводит к увеличению длины ROH у их гибридов, что было продемонстрировано на примере гибридов брамы светлой и суссекс, которые имеют общего предка - породу кохинхин. Удаленность гибридов от корнишей по критерию индекса фиксации (Fst) была значительно выше, чем исходных чистопородных форм между собой. Таким образом, анализ количества и протяженности ROH позволяет оценить вклад исходных пород в формирование генетической структуры двухпородных гибридов кур.