Open AccessРанжированный ряд фрагментов молекул лекарственных средств, определяющих их нейродоступность
Author(s) -
Pavel Polishchuk,
Анна Павловна Косинская,
В. Б. Ларіонов,
L. N. Ognichenko,
Виктор Евгеньевич Кузьмин,
Николай Яковлевич Головенко
Publication year - 2017
Publication title -
himiko-farmacevtičeskij žurnal
Language(s) - Russian
Resource type - Journals
ISSN - 0023-1134
DOI - 10.30906/0023-1134-2017-51-1-35-38
Subject(s) - quantitative structure–activity relationship , mathematics , statistics , computer science , machine learning
Использование методов компьютерного моделирования на основе зависимости «структура — свойство» (QSPR) позволяет рационально планировать как проведение экспериментальных исследований, так и осуществлять эффективное генерирование структур, обладающих способностью проникать через ГЭБ. Целью работы было создание моделей «структура — свойство» на основе симплексного представления молекул для внеэкспериментальной оценки их способности проникать через ГЭБ, и проведение структурной интерпретации построенных моделей, учитывающей взаимное влияние атомов в молекуле. С использованием метода симплексного представления молекулярной структуры был оценен вклад различных молекулярных фрагментов и функциональных групп в величину нейродоступности диффундирующих через ГЭБ соединений. Показано, что наличие сильно полярных и ионогенных групп (карбоксильная, карбонильная, фенольный гидроксил) негативно сказывается на способности веществ проникать в мозг. Наличие атомов галогена и ароматических фрагментов положительно влияет на эффективность переноса молекул через ГЭБ. Построенная QSPR модель характеризуется удовлетворительной прогнозирующей способностью, оцененной согласно внутренней процедуре валидации моделей RandomForest (R2 = 0,54, RMSE = 0,47).