Open AccessIdentifikasi Ikan Genus Mystus Dengan Pendekatan Genetik
Author(s) -
Taufik Budhi Pramono,
Diana Arfiati,
Maheno Sri Widodo,
Uun Yanuhar
Publication year - 2017
Publication title -
jurnal sumberdaya akuatik indopasifik
Language(s) - English
Resource type - Journals
eISSN - 2550-1232
pISSN - 2550-0929
DOI - 10.30862/jsai-fpik-unipa.2017.vol.1.no.2.34
Subject(s) - biology , zoology
Ikan-ikan dari Famili Bagridae di Indonesia mencapai 60 jenis dan salah satunya dari genus Msytus. Metode yang digunakan untuk identifikasi ikan yang sangat cepat dan akurat sangat diperlukan. DNA barcoding adalah teknik identifikasi baru dengan pendekatan molekular. Gen CO1 diamplifikasi dan produk PCR disekuensing serta dianalisis dengan menggunakan software bioinformatika. Pengeditan hasil sekuensing dan penentuan komposisi nukleotida dianalisis dengan software Mega5. Urutan DNA disejajarkan dengan ClustalW vers. 1.4. Sekuens dibandingkan dengan data GenBank menggunakan BLAST (Basic Local Aligment Search Tools) dan BOLDSystems. Pohon filogenetik dibuat dengan menggunakan metode Neighbor_Joining. Salah satu contoh identifikasi ikan dari genus Mystus yang telah dikonfirmasi adalah Mystus nigriceps menjadi Mystus singaringan.