
Advantages of high throughput parallel sequencing in detecting somatic mosaicism in sporadic retinoblastoma
Author(s) -
Е. А. Алексеева,
О. В. Бабенко,
В. М. Козлова,
Т.Л. Ушакова,
Т. П. Казубская,
А. С. Танас,
К. И. Карандашева,
В. В. Стрельников,
D. V. Zaletaev
Publication year - 2020
Publication title -
medicinskaâ genetika
Language(s) - English
Resource type - Journals
ISSN - 2073-7998
DOI - 10.25557/2073-7998.2020.06.6-7
Subject(s) - retinoblastoma , somatic cell , genetics , biology , gene , allele , medicine
Почти 80% случаев наследственной ретинобластомы не имеют семейного анамнеза и возникают в результате мутаций de novo в гене RB1. Методом высокопроизводительного параллельного секвенирования (ВПС) проведено молекулярно-генетическое обследование 208 неродственных больных со спорадической РБ, среди которых 145 пациентов с унилатеральной формой заболевания и 63 - с билатеральной. В группе пациентов с билатеральной РБ молекулярные изменения в гене RB1 обнаружены в 90,5% (57/63) случаев. У 4,8% (3/63) пациентов определен мозаичный вариант мутации в гене RB1. В группе пациентов с унилатеральной РБ молекулярные изменения в гене RB1 выявлены в 17,9% (26/145) случаев. Среди исследованных пациентов соматический мозаицизм выявлен в 9,0% (13/165) случаев. Применение ВПС позволяет точно определять аллельную частоту вариантов, что делает поиск соматического мозаицизма эффективным. Almost 80% of cases of hereditary retinoblastoma do not have a family history and arise as a result of de novo mutations in the RB1 gene. An NGS test was performed on 208 unrelated patients with sporadic RB, including 145 patients with a unilateral form and 63 patients with a bilateral one. In the group of patients with bilateral RB, pathogenic variants in the RB1 gene were detected in 90.5% (57/63) cases. In 4.8% (3/63) of patients, a mosaic variants were determined. In the group of patients with unilateral RB, changes in the RB1 gene were detected in 17.9% (26/145) cases. Among the examined patients, somatic mosaicism was detected in 9.0% (13/165) cases. NGS allows us to determine the allelic frequency of variants, which makes the search for somatic mosaicism effective.