
Molecular markers of T2DM in obesity: expression profile of inflammatory response genes in peripheral blood mononuclear cells
Author(s) -
O. V. Kochetova,
L. Z. Akhmadishina,
Д. Ш. Авзалетдинова,
З. А. Шангареева,
G. F. Korytina
Publication year - 2020
Publication title -
medicinskaâ genetika
Language(s) - English
Resource type - Journals
ISSN - 2073-7998
DOI - 10.25557/2073-7998.2020.05.92-94
Subject(s) - chemokine , cxcl1 , peripheral blood mononuclear cell , cxcl2 , cxcl16 , immune system , cxcl10 , immunology , ccl2 , medicine , endocrinology , biology , genetics , chemokine receptor , in vitro
Сахарный диабет 2 типа (СД2) - метаболическое многофакторное, генетически обусловленное, опасное для жизни заболевание. Развитие осложнений связано с хроническим иммуновоспалительным процессом и с образованием иммунных комплексов. Целью исследования явился анализ профиля экспрессии комплекса функционально взаимосвязанных генов (цитокинов, хемокинов и другие ключевые молекулы воспалительного ответа) в мононуклеарах периферической крови у пациентов с СД2 (N=10) и в контрольной группе (N=10). Пациенты и контроль были подобраны по полу, возрасту, принадлежали к этнической группе татар. Профиль экспрессии 84 генов иммунного ответа исследовали методом OT-ПЦР на приборе BioRad CFX96TM набором RT2 Profiler PCR Arrays «Human Cytokines & Chemokines PCR Array» (Qiagen). Значимые изменения экспрессии (p<0,05) в общей группе больных СД2 по сравнению с контролем были установлены для генов FASLG, IL16, OSM, CSF1, CXCL16, BMP6. При этом профиль экспрессии этих генов у больных СД2 характеризуется повышением уровня от 2,1 до 6,7 раз по сравнению со здоровыми индивидами. Профиль экспрессии генов CXCL8, CXCL1, CXCL2, CXCL10, CCL2, IL1RN характеризуется снижением уровня от 2,1 до 8,78 раз по сравнению со здоровыми индивидами. Значимые статистические различия при снижении экспрессии были получены для генов IL1RN (fold-change (FCh)=-3,31, p=0,013), CXCL1 (FCh=-2,74, p=0,027), CXCL2 (FCh=-2,66, p=0,038). Наиболее значимое повышение транскрипционной активности было показано для генов IL16 (FCh=6,72, p=0,037) и FASLG (FCh=2,83 p=0,034) среди больных СД2 по сравнению с контрольной группой. Type 2 diabetes mellitus (T2DM) is a metabolic multifactorial, genetically determined, life-threatening disease. The development of complications is associated with a chronic immuno-inflammatory process and with the formation of immune complexes. The aim of the study was to analyze the expression profile of a complex of functionally interconnected genes (cytokines, chemokines, and other key molecules of the inflammatory response) in peripheral blood mononuclear cells in patients with T2DM (N = 10) and in the control group (N = 10). Patients and controls were matched by gender, age, and belonged to the Tatars ethnic group. The expression profile of 84 immune response genes was studied by OT-PCR on a BioRad CFX96TM instrument using the Human Cytokines & Chemokines PCR Array RT2 Profiler PCR Arrays kit (Qiagen). Significant changes in expression (p <0.05) in the general group of patients with T2DM compared with the control were found for the FASLG, IL16, OSM, CSF1, CXCL16, BMP6 genes. Moreover, the expression profile of these genes in patients with type 2 diabetes is characterized by an increase in the level from 2.1 to 6.7 times in comparison with healthy individuals. The gene expression profile of CXCL8, CXCL1, CXCL2, CXCL10, CCL2, IL1RN is characterized by a decrease in the level from 2.1 to 8.78 times in comparison with healthy individuals. Significant statistical differences with a decrease in expression were obtained for the genes IL1RN (fold-change (FCh) = - 3.31, p = 0.013), CXCL1 (FCh = -2.74, p = 0.027), CXCL2 (FCh = -2.66, p = 0.038) . The most significant increase in transcriptional activity was shown for the genes IL16 (FCh = 6.72, p = 0.037) and FASLG (FCh = 2.83 p = 0.034) among patients with type 2 diabetes compared with the control group.