Open AccessAssociations of polymorphic variants of the vascular endothelial growth factor А gene with the development of coronary heart disease in Central Russia
Author(s) -
М. В. Медведева,
Maria Solodilova,
Marina Bykanova,
Н В Иванова,
А. В. Полоников
Publication year - 2020
Publication title -
medicinskaâ genetika
Language(s) - English
Resource type - Journals
ISSN - 2073-7998
DOI - 10.25557/2073-7998.2020.05.52-53
Subject(s) - haplotype , single nucleotide polymorphism , genetics , biology , snp , linkage disequilibrium , allele , gene , genotype
Изучен вклад однонуклеотидных полиморфизмов (SNPs) rs3025039, rs833061, rs3025000 и rs833068 гена VEGFA в развитие ишемической болезни сердца (ИБС). Установлена ассоциация rs3025039, rs833061 и rs3025000 с ИБС у мужчин. При изучении гаплотипов установлены ассоциации rs833061T-rs833068A-rs3025000T-rs3025039C и rs833061T-rs833068G-rs3025000C- rs3025039С с пониженным риском развития ИБС у мужчин, гаплотипа rs833061C-rs833068G-rs3025000C-rs3025039T и редких гаплотипов (частота <1%) - с повышенным риском развития ИБС у женщин. Также в работе было выявлено, что аллель rs833061T находится в отрицательном неравновесии по сцеплению (LD) с аллелями rs833068G и rs3025000C у мужчин и положительном LD у женщин, а rs3025039 - в слабом положительном LD с SNP rs3025039 у мужчин. The contribution of single-nucleotide polymorphisms (SNPs) rs3025039, rs833061, rs3025000 and rs833068 of the VEGF gene to the development of CHD was studied. The Association of rs3025039, rs833061 and rs3025000 with CHD in men was established. The study of haplotypes established associations rs833061T-rs833068A-rs3025000T-rs3025039C and rs833061T-rs833068G-rs3025000C - gs3025039c with a reduced risk of CHD in men, haplotype rs833061C-rs833068G-rs3025000C-rs3025039T and rare haplotypes (frequency <1%) - with an increased risk of CHD in men CHD in women. It was also found that the rs833061T allele is in a negative coupling disequilibrium (LD) with the rs833068G and rs3025000C alleles in men and a positive LD in women, and rs3025039 is in a weak positive LD with the SNP rs3025039 in men.