Open AccessSearch for circular RNAs of the genes involved in lipid metabolism and atherogenesis
Author(s) -
Elena V. Nosova,
Ivan B. Filippenkov,
Alexandra V. Rozhkova,
В. Г. Дмитриева,
Alexander D. Dergunov,
С А Лимборская,
Lyudmila V. Dergunova
Publication year - 2020
Publication title -
medicinskaâ genetika
Language(s) - English
Resource type - Journals
ISSN - 2073-7998
DOI - 10.25557/2073-7998.2020.05.46-47
Subject(s) - gene , function (biology) , biology , rna , lipid metabolism , competing endogenous rna , microrna , endogeny , non coding rna , gene expression , genetics , long non coding rna , computational biology , biochemistry
Известно, что некодирующие регуляторные РНК влияют на функцию генов. Ранее мы обнаружили отрицательную корреляцию уровня холестерина липопротеинов высокой плотности (ХС-ЛВП) с содержанием транскриптов ряда генов, участвующих в метаболизме ЛВП и в атерогенезе. В данной работе проведен поиск циклических РНК генов HDLBP и TNFRSF1A, а также анализ их представленности в мононуклеарных клетках пациентов с различающимся содержанием ХС-ЛВП. С помощью биоинформатического анализа предсказаны сети возможных конкурентных взаимодействий миРНК с мРНК или циклоРНК данных генов. Сделано предположение, что обнаруженные циклические РНК играют роль конкурентных эндогенных молекул, участвующих в регуляции функционирования соответствующих генов. Non-coding regulatory RNAs are known to affect gene function. We found earlier a negative correlation of high-density lipoprotein cholesterol (HDL-C) with transcripts of some genes involved in HDL metabolism and atherogenesis. In this work, we searched for circular RNA of HDLBP and TNFRSF1A genes in mononuclear cells of patients with different level of HDL-C. The network of competitive interactions of siRNAs with mRNA or circRNA of these genes are predicted by bioinformatic analysis. These circRNAs are suggested to function as the competitive endogenous molecules that are involved in the regulation of gene function.