Open AccessAnalysis of MIR21 gene methylation level in blood vessels and leukocytes in carotid atherosclerosis by targeting bisulphite sequencing
Author(s) -
Ю. А. Королёва,
А. В. Марков,
А. А. Слепцов,
А. А. Зарубин,
Э. Ф. Муслимова,
С. А. Афанасьев,
М. С. Кузнецов,
Б. Н. Козлов,
М. С. Назаренко
Publication year - 2020
Publication title -
medicinskaâ genetika
Language(s) - English
Resource type - Journals
ISSN - 2073-7998
DOI - 10.25557/2073-7998.2020.05.41-43
Subject(s) - cpg site , dna methylation , methylation , biology , gene , bisulfite sequencing , pathology , microbiology and biotechnology , medicine , gene expression , genetics
Методом таргетного бисульфитного секвенирования проанализирован уровень метилирования предполагаемого промоторного региона, CpG-островка и «тела» гена MIR21 в сосудах и лейкоцитах крови у пациентов с атеросклерозом сонных артерий, а также в лейкоцитах крови здоровых индивидов. Выявлено гипометилирование CpG-сайтов в гене MIR21 в сосудах по сравнению с лейкоцитами (вне зависимости от наличия заболевания). В атеросклеротической бляшке 4 последовательных CpG-сайта «тела» гена MIR21 оказались значимо гипометилированы относительно предлежащей макроскопически интактной части сонной артерии. Таким образом, установлена тканеспецифичность метилирования CpG-сайтов в гене MIR21 в сосудах, а также его связь с атеросклерозом сонных артерий. We analyzed the DNA methylation level of MIR21 gene (proposed promoter, CpG island and gene body) by targeted bisulfite sequencing in blood vessels and leukocytes of patients with carotid artery atherosclerosis and in blood leukocytes of healthy individuals. We detected DNA hypomethylation at the CpG sites in the MIR21 gene in the blood vessels compared to the leukocytes (regardless of the disease). At the same time, 4 consecutive CpG sites of the MIR21 gene body were significantly hypomethylated in atherosclerotic carotid plaque compared to nearby macroscopically intact tissue. Thus, we have shown the tissue specificity at the CpG sites in the MIR21 gene for vessels and its association with carotid artery atherosclerosis.