Open AccessGenome-wide RNA sequencing as a method for assessing the effects of synthetic derivatives of melanocortin under normal conditions and under acute stress
Author(s) -
Ivan B. Filippenkov,
В.В. Ставчанский,
Н.Ю. Глазова,
Е. А. Себенцова,
Н.Г. Левицкая,
Н.Ф. Мясоедов,
С А Лимборская,
Lyudmila V. Dergunova
Publication year - 2020
Publication title -
medicinskaâ genetika
Language(s) - English
Resource type - Journals
ISSN - 2073-7998
DOI - 10.25557/2073-7998.2020.05.101-102
Subject(s) - melanocortin , melanocortin 4 receptor , transcriptome , rna , melanocortin 3 receptor , allosteric regulation , biology , receptor , rna seq , peptide , gene , computational biology , gene expression , chemistry , genetics , biochemistry , melanocortin receptor
В целях исследования молекулярных механизмов действия пептидов меланокортинового ряда был проведен сравнительный анализ действия семакса и его структурного аналога АКТГ(6-9)PGP на транскриптом гиппокампа крыс в норме и условиях острого стресса с помощью метода RNA-Seq. Полученные результаты выявили общие и специфические эффекты пептидов меланокортинового ряда в регулировании экспрессии генов в условиях острого стресса и нормы. Предложена модель формирования ответа транскриптома на введение пептидов, основанная на аллостерическом взаимодействии пептидов с рецепторами. In order to study the molecular mechanisms of action of the peptides of the melanocortin series, a comparative analysis of the effect of Semax and its structural analogue of ACTH(6-9)PGP on transcripts of rat hippocampus under normal and acute stress conditions was performed using the RNA-Seq method. The results revealed common and specific effects of peptides in the regulation of gene expression under acute stress and normal conditions. We proposed a model for the formation of transcriptome response to peptide administration based on allosteric interaction of peptides with receptors.