Open Accessالعلاقة المظهرية والجينية لانواع جنس Streptomyces spp. المعزولة من الترب الملوثة بالهيدروكاربونات
Author(s) -
Esraa Gh. Al-Sammak
Publication year - 2017
Publication title -
maǧallaẗ markaz buḥūṯ al-taqniyyaẗ al-aḥyāʾiyyaẗ
Language(s) - Arabic
Resource type - Journals
eISSN - 2708-1370
pISSN - 1815-1140
DOI - 10.24126/jobrc.2017.11.2.527
Subject(s) - streptomyces coelicolor , streptomyces , streptomyces albus , streptomycetaceae , microbiology and biotechnology , biology , actinomycetales , bacteria , genetics
يهدف البحث الى تسليط الضوء على دور التصنيف المتعدد Polyphasic والذي يضم كل من التصنيف المظهري والجيني لتحديد وتثبيت صفات النوع ضمن جنس الـStreptomyces الصعب التصنيف نتيجة كثرة الانواع والتغاير الكبير في الصفات المظهرية اضافة لدورها في مجالات عدة منها البيئة من خلال تحملها العديد من املاح العناصرالثقيلة الموجودة في البيئات الملوثة بالهيدروكاربونات واشتراكها في التخلص من الملوثات. تم عزل وتشخيص ست عزلات من البكتريا الخيطية التابعة لجنس Streptomyces من عشرين عينة تربة ملوثة بالهيدروكاربونات وترب حدائق . شخصت الى ثلاثة انواع اعتمادا على دراسة الصفات المظهرية والجينية من خلال دراسة تتابع جزء الـ16SrDNA باستخدام البادئ 27f و 1392r وشخصت سلالتين على انها تابعة للنوع Streptomyces flavogriseus ATCC 33331 وسلالتين للنوع Streptomyces coelicolor A3(2) واخيرا سلالتين تابعة للنوع Streptomyces albus J1074 . اعتمادا على الصفات المظهرية والبالغة 48 صفة و باستخدام التصنيف العددي والربط باستخدام المعدل الموزون و معامل التشابه البسيط Simple matching coefficient (Ssm) باستخدام البرنامج الاحصائي SPSS , تعنقدت السلالات في ثلاثة عناقيد ضمن المخطط الشجري ضم العنقود A سلالتين للنوعStreptomyces coelicolor مرتبطة عند نسبة تشابه 99% في حين تعنقدت سلالتي النوع Streptomyces albus ضمن العنقود B وعند نسبة تشابه 95% كما تعنقدت سلالتي النوع Streptomyces flavogriseus ضمن العنقود C وبنسبة تشابه 95% . اظهرت الانواع المعزولة مستعمرات طباشيرية رصاصية الى بيضاء وتميز الغزل الهوائي للنوع Streptomyces albus بكونه حلزوني مكبوس متفرع وكثيف في حين تميز بكون خيوط الغزل الهوائي متعرج وغير متفرع للنوع Streptomyces flavogriseus وظهر الغزل الهوائي للنوع Streptomyces coelicolor متفرع متحلزن ومتعرج و جميعها منتجة لرائحة التربة. اظهرت جميع الانواع قيد الدراسة حساسية لاملاح كل من كلوريد وكبريتات الزئبق , في حين اظهرت جميع الانواع مقاومة لكل من كلوريد ونترات الكوبلت و كبريتات الزنك و نترات وخلات الرصاص و كبريتات النيكل و خلات الفضة وثنائي اوكسيد التيتانيوم . اعطت جميع الانواع حساسية للمضاد الحيوي,Ciprofloxacin 10 مايكروغرام , 10 Tobramycinمايكروغرام , Gentamicin 10 مايكروغرام , Vancomycin 30 مايكروغرام , Amikacin10مايكروغرام, Imipenem 10مايكروغرام. كما تعنقدت الانواع ايضا عند استخدام التصنيف الجيني الى ثلاثة عناقيد ضمن الشجرة التطورية وبنسب تشابه تراوحت بين 96.7- 99.4 %باستخدام Clustal W وطريقة maximum likelihood method باستخدام برنامج Mega 5.