
ANALISIS IN SILICO PROTEIN CLOCK (CIRCADIAN LOCOMOTOR OUTPUT CYCLES KAPUT) PADA Patagioenas fasciata monilis
Author(s) -
Suprianto Suprianto
Publication year - 2021
Publication title -
jurnal sains dan teknologi
Language(s) - Uncategorized
Resource type - Journals
eISSN - 2548-8570
pISSN - 2303-3142
DOI - 10.23887/jst-undiksha.v10i1.24888
Subject(s) - physics , biology , zoology , humanities , microbiology and biotechnology , philosophy
CLOCK merupakan protein penting yang berperan dalam adaptasi ekologi dan fisiologi organisme. Studi sebelumnya menjelaskan bahwa CLOCK memiliki pengaruh terhadap perubahan perilaku hewan. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis protein CLOCK pada burung Patagioenas fasciata monilis. Metode yang digunakan pada penelitian ini adalah metode homologi. Hasil struktur model berdasarkan assessment menunjukkan akurasi model yang mendekati struktur sebenarnya. Struktur model yang diperoleh memiliki berat 96200,04 Daltons, tiga daerah struktur beta-sheet, lima daerah struktur alpha-helix, 1,47 % daerah outliers, dua residu C-Beta Deviations, nilai identity 94,43 %, 34 sudut buruk, nilai QMEAN -1,69 dan nilai GMQE 0,31. Kata Kunci : CLOCK, Patagioenas fasciata monilis, in silico, homologi