Notion de gène candidat

Lorsque l’analyse de performances permet de montrer qu’un gène gouverne une part importante de la variabilité d’un caractère, diverses approches sont possibles pour l’identifier : l’étude de candidats physiologiques afin d’identifier le gène recherché parmi les gènes connus intervenant dans ce caractère ; la cartographie fine de la région pour déterminer très précisément la position du gène recherché, jusqu’à ne plus trouver qu’un seul gène à cet endroit (démarche de clonage positionnel). Le plus souvent, le gène responsable est identifié par une combinaison de ces deux approches, en trouvant un candidat positionnel situé dans l’intervalle restreint où il est attendu. Dans certains cas cependant, l’étude de gènes connus ayant un effet similaire dans une autre espèce, permettra d’identifier rapidement le gène responsable.