
A 37-kb restriction map of the human immunoglobulin lambda variable locus, VB cluster, harboring four functional genes and two non-coding V<FONT FACE=Symbol>l</font> sequences
Author(s) -
Geraldo Aleixo Silva Passos,
MariePaule Lefranc
Publication year - 1997
Publication title -
brazilian journal of genetics
Language(s) - Portuguese
Resource type - Journals
eISSN - 1678-4502
pISSN - 0100-8455
DOI - 10.1590/s0100-84551997000400027
Subject(s) - cosmid , biology , pseudogene , font , locus (genetics) , genetics , gene , subcloning , coding region , microbiology and biotechnology , plasmid , genome , computer science , operating system
The human immunoglobulin lambda variable locus (IGLV) is mapped at chromosome 22 band q11.1-q11.2. The 30 functional germline v-lambda genes sequenced untill now have been subgrouped into 10 families (Vl1 to Vl10). The number of Vl genes has been estimated at approximately 70. This locus is formed by three gene clusters (VA, VB and VC) that encompass the variable coding genes (V) responsible for the synthesis of lambda-type Ig light chains, and the Jl-Cl cluster with the joining segments and the constant genes. Recently the entire variable lambda gene locus was mapped by contig methodology and its one- megabase DNA totally sequenced. All the known functional V-lambda genes and pseudogenes were located. We screened a human genomic DNA cosmid library and isolated a clone with an insert of 37 kb (cosmid 8.3) encompassing four functional genes (IGLV7S1, IGLV1S1, IGLV1S2 and IGLV5a), a pseudogene (VlA) and a vestigial sequence (vg1) to study in detail the positions of the restriction sites surrounding the Vl genes. We generated a high resolution restriction map, locating 31 restriction sites in 37 kb of the VB cluster, a region rich in functional Vl genes. This mapping information opens the perspective for further RFLP studies and sequencing O locus lambda variável (IGLV) situa-se no cromossomo 22 banda q11.1-q11.2. Os 30 genes v-lambda germinativos e funcionais sequenciados até o momento foram distribuídos em 10 famílias (Vl1 a Vl10). O número de genes Vl está próximo de 70. Este locus é formado por três grupamentos gênicos (VA, VB e VC) que contêm os genes codificadores das regiões variáveis (V) da cadeia leve tipo lambda e o grupamento Jl-Cl com os segmentos de junção (J) e genes das regiões constantes (C). Recentemente o locus IGLV foi mapeado (mapa físico) pela técnica dos "contigs" e seu um megabase de DNA totalmente seqüenciado, posicionando todos os genes Vl funcionais e os pseudogenes. Neste trabalho, nós isolamos um clone de cosmídeo com 37 kb de inserto (cosmídeo 8.3) de uma biblioteca genômica humana preparada no vetor Lorist-6. Este cosmídeo contém quatro genes Vl funcionais (IGLV7S1, IGLV1S1, IGLV1S2 e IGLV5a), um pseudogene (VlA) e uma seqüência vestigial (vg1) e nos permitiu estudar com detalhe as posições de sítios de restrição em torno dos genes Vl. Geramos um mapa de restrição de alta resolução, localizando 31 sítios de restrição no grupamento gênico VB, uma região rica em genes Vl funcionais. Estas informações sobre mapeamento abrem a perspectiva para estudos sobre RFLP e seqüenciament