Open AccessΔιερεύνηση του μηχανισμού δράσης των ογκοκατασταλτικών πρωτεϊνών p21WAF1/CIP1 και ARF
Author(s) -
Παναγιώτα Παπανάγνου
Publication year - 2021
Language(s) - Slovenian
Resource type - Dissertations/theses
DOI - 10.12681/eadd/41756
Subject(s) - frame (networking) , reading (process) , dna damage , materials science , computer science , dna , chemistry , computer network , political science , biochemistry , law
Η p21WAF1/CIP1 είναι ένας «καθολικός» αναστολέας των κυκλινο-εξαρτώμενων κινασών και παίζει κρίσιμο ρόλο στο μονοπάτι της απόκρισης στην βλάβη του DNA (DDR). Η p21WAF1/CIP1 είναι ένα πολυλειτουργικό μόριο ενώ στην καρκινογένεση ο αρχικός της χαρακτηρισμός της ως ογκοκατασταλτικής πρωτεΐνης να αμφισβητείται. Στην παρούσα έρευνα χρησιμοποιήθηκε ένα επαγώγιμο κυτταρικό σύστημα, το Saos2-p21WAF1/CIP1 Τet ON, και διενεργήθηκε ελεύθερη-γέλης πρωτεωμική ανάλυση iTRAQ σε 3 διαφορετικά χρονικά σημεία μετά την επαγωγή της p21WAF1/CIP1, δηλ. στις 12, 48 και 96 ώρες, με σκοπό να αποσαφηνιστούν οι ογκογενετικές ιδιότητες της p21WAF1/CIP1 που πιθανό να σκιαγραφούνται καλύτερα όταν η έκφραση της p21WAF1/CIP1 είναι παρατεταμένη και απουσιάζει η ογκοκατασταλτική πρωτεΐνη p53. Η πρωτεωμική ανάλυση ακολουθούμενη από αναλύσεις δεδομένων με την βοήθεια βιοπληροφορικής έδειξε πως ανάμεσα στις περισσότερο επηρεαζόμενες πρωτεΐνες που υφίστανται αυξορρύθμιση και μειορρύθμιση από την p21WAF1/CIP1 είναι εκείνες που συμμετέχουν στην αντιγραφή του DNA και την μίτωση, αντίστοιχα. Δεδομένου ότι η απορρύθμιση της αντιγραφικής αλλά και της μιτωτικής μηχανής έχουν συνδεθεί με την πυροδότηση της γενωμικής αστάθειας, τα αποτελέσματα της παρούσας έρευνας προσφέρουν νέα στοιχεία για την ογκογενετική συμπεριφορά της p21WAF1/CIP1.H ΑRF (alternative reading frame) από την άλλη, είναι και αυτή όπως η p21 Waf1 μία ογκοκατασταλτική πρωτεΐνη με πολλαπλές κυτταρικές λειτουργίες. Πρόσφατα βρέθηκε πως υπάρχει μία αλληλεπίδραση του μονοπατιού της ARF με την DDR, συγκεκριμένα την DDR κινάση ΑΤΜ. Στην παρούσα μελέτη, εφαρμόζοντας μία σειρά μοριακών και in situ τεχνικών, αλλά και βιοπληροφορικής διερευνήθηκε η σχέση της ARF με την ATM-σχετιζόμενη κινάση ATR και την MKK7 που είχε δειχθεί πως σταθεροποιεί την p53 σε απόκριση σε ογκογονικά ερεθίσματα. Επιπλέον αναλύθηκαν ξενομοσχεύματα σε ποντίκια για να χαρακτηρισθεί η αντι-αγγειογενετική δράση της ΑRF όταν καταστέλλεται η ΑΤΜ. Τα αποτελέσματα δείχνουν ότι η ARF συμμετέχει σε ένα πολυπλοκότερο δίκτυο σχέσεων στην DDR απ’ ότι ήταν τώρα γνωστό και ότι η καταστολή της ΑΤΜ μπορεί να χρησιμοποιηθεί ακόμα και σε όγκους που δεν εκφράζουν την p53 ως θεραπευτική αντι-αγγειογενετική προσέγγιση μέσω της αυξορρύθμισης της ARF.