Mitochondrial DNA analysis of Phialophora verrucosa

Summary. Restriction fragment length polymorphism (RFLP) of mitochondrial DNA (mtDNA) was examined in 32 isolates of Phialophora verrucosa (eight isolates from Japan, 10 from China, four from the USA, six from Venezuela and four from Colombia) and in three of Phialophora americana using five restriction enzymes. P. verrucosa isolates were divided into 10 mtDNA types based on RFLP patterns. Phylogeny constructed on sequence divergence of mtDNA indicated that P. verrucosa is a single species and isolates are clustered into three groups. Japan and the USA contained Group A and Group B isolates, China Group B isolates and South America Group B and Group C isolates. RFLP patterns of P. americana mtDNA were identical to those of Type 1 or Type 4 of P. verrucosa mtDNA, suggesting that both are identical. RFLP patterns of P. verrucosa were distinct from those of other dematiaceous fungi including Exophiala jeanselmei, E. moniliae, E. dermatitidis, E. spinifera, Cladophia‐lophora (Cladosporium) carrionii, Fonsecaea pedrosoi , and Hortaea werneckii . These results indicate that RFLP analysis of mtDNA is a useful method for the identification, taxonomy, typing, epidemiology and phylogeny of P. verrucosa . Zusammenfassung. Restriktionsfragmentlängen‐Polymorphismus (RFLP) der mitochondrialen DNA (mtDNA) wurde an 36 Stämmen der Art Phialophora verrucosa (8 aus Japan, 10 aus China, 4 aus USA, 6 aus Venezuela und 4 aus Kolumbien) und an 3 Stämmen der Art Phialophora americana mit 5 Restriktionsenzymen untersucht. Die P. verrucosa ‐Stämme wurden anhand ihrer RFLP Muster in 10 unterschiedliche mtDNATypen eingeteilt. Phylogenie‐Betrachtungen, die auf Sequenzunter‐schieden der mtDNA aufbauen, zeigen, dass P. verrucosa genetisch eine einzige Art ist. Die Stämme wurden in 3 Gruppen geteilt. Die Stämme aus Japan und USA befinden sich in Gruppe A und B, die aus China in Gruppe B und die aus Südamerika in Gruppe B und C. RFLP‐Muster von P. americana mtDNA waren mit denen der Typen 1 und Typen 4 von P. verrucosa mtDNA identisch, was andeutet, dass P. americana und P. verrucosa identisch sind. RFLP‐Formen von P. verrucosa unterschieden sich von denen von Exophiala jeanselmei, E. moniliae, E. dermatitidis, E. spinifera, Cladophialophora (Cladosporium) carrionii, Fonsecaea pedrosoi und Hortaea werneckii . Die Ergebnisse zeigen, dass die RFLP‐Analyse der mtDNA eine geeignete Methode zur Identifizierung, Taxonomie, Typisierung, Epidemiologie und Phylogenie von P. verrucosa ist.