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Comparison of morphotypic and genotypic methods for strain delineation in Candida
Author(s) -
Castillo L. Del,
Bikandi J.,
Nieto Almudena,
Quindós G.,
Sentandreu R.,
Pontón J.
Publication year - 1997
Publication title -
mycoses
Language(s) - English
Resource type - Journals
SCImago Journal Rank - 1.13
H-Index - 69
eISSN - 1439-0507
pISSN - 0933-7407
DOI - 10.1111/j.1439-0507.1997.tb00182.x
Subject(s) - genotype , strain (injury) , biology , computational biology , microbiology and biotechnology , genetics , gene , anatomy
Summary. We compared two phenotypic methods, colony morphotyping on Sabouraud‐tripheniltetrazolium agar (STTZ) and serotyping, with two genotypic methods, karyotyping and Random Amplified Polymorphic DNA bands obtained by PCR amplification (RAPD‐PCR), for strain delineation in 33 Candida clinical isolates and two C. albicans strains from culture collections. Analysis of isolates on STTZ showed 11 different morphotypes. In two patients there was a switch in the morphotype coincidential with a change in the susceptibility of the isolates to azole antifungals. C. albicans isolates were divided into two serotypes. Sixteen and 18 different patterns were identified among the Candida isolates by karyotyping and RAPD‐PCR, respectively. No relationship was found between any of the typing methods used and the source of the isolates. The combination of karyotyping and morphotyping on STTZ yielded useful epidemiological information, since it allowed the differentiation among the Candida species studied and the discrimination of clusters within C. albicans as well as to check the capacity of a strain to generate variants with different susceptibility to some antifungals. Zusammenfassung. Wir haben zur Stammdifferenzierung bei 33 klinischen Candida ‐Isolaten zwei phänotypische Methoden — Kolonie‐Morphotypisierung auf Sabouraud‐Triphenyltetrazolium‐Agar (STTZ) und Serotypisierung — mit zwei genotypischen Methoden — Karyotypisierung und ‘random amplified polymorphic’ DNA, welche mittels der Polymerase‐Kettenreaktion erhalten wurden (RAPD‐PCR) — verglichen. Die Analyse der Isolate auf STTZ ergab 11 verschiedene Morphotypen. Bei zwei Patienten fand ein Switch des Morphotyps im Zusammenhang mit einem Wechsel der Sensibilität gegenüber Antimyzetika der Azolgruppe statt. C. albicans ‐Isolate wurden in zwei verschiedene Serotypen unterteilt. Sechzehn und 18 verschiedene Muster wurden bei C. albicans jeweils mittels Karyotypisierung und RAPD‐PCR identifiziert. Es konnte kein Zusammenhang zwischen irgendeiner der angewandten Typisierungsmethoden und dem Ursprung der Isolate ermittelt werden. Die Kombination von Karyotypisierung und Morphotypisierung auf STTZ ergab brauchbare epidemiologische Information, da sie erlaubte, die untersuchten Candida ‐Arten zu differenzieren, Unterarten von C. albicans zu identifizieren sowie die Fähigkeit eines Stammes zu prüfen, Varianten zu entwickeln, welche gegenüber Antimyzetika verschiedene Sensibilität aufweisen.