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Estimation of genetic value of showjumping horses from the ranking of all performances in all competitions
Author(s) -
Reilly M.,
Foran M. K.,
Kelleher D. L.,
Flanagan M. J.,
Brophy P. O.
Publication year - 1998
Publication title -
journal of animal breeding and genetics
Language(s) - English
Resource type - Journals
SCImago Journal Rank - 0.689
H-Index - 51
eISSN - 1439-0388
pISSN - 0931-2668
DOI - 10.1111/j.1439-0388.1998.tb00324.x
Subject(s) - heritability , statistics , ranking (information retrieval) , restricted maximum likelihood , variance components , competition (biology) , trait , variance (accounting) , genetic correlation , best linear unbiased prediction , population , estimation , mathematics , econometrics , selection (genetic algorithm) , biology , genetic variation , computer science , demography , maximum likelihood , engineering , machine learning , evolutionary biology , economics , ecology , accounting , systems engineering , sociology , programming language
Summary In the genetic evaluation of showjumping horses, the trait of interest is showjumping ability. Since this cannot be observed directly, traditional genetic evaluation systems have used various measures of the relative ability of horses, such as money won or points awarded in competition. However, such analyses have limitations for the genetic evaluation of a population of performing horses, as they fail to take account of any performances which do not earn points (or money), so that there is no record of poor performances in competition and no adjustment is made for the total number of competitions in which each horse performed. There is no satisfactory way to accommodate the number of ‘starts’ in analysis so that the effect of the total number of starts is appropriately reflected in the accuracy of the genetic evaluations. This paper presents a method which overcomes the above limitations by using information from all horses in all competitions to estimate the variance components (for random effects) and the BLUP breeding values using an animal model. Horses were ranked from first to last in each competition and these ranks were then converted to normal scores, which served as a measure of the relative showjumping ability. The method was applied to 160084 records from 6786 horses in 7313 showjumping competitions in Ireland in the 4‐year period 1993–1996. Components of variance for additive genetic, permanent environment and temporary environment were estimated using REML‐VCE (G roeneveld 1994). The heritability of individual performances was estimated as 0.08, the repeatability within animal was 0.20, and single trait animal model BLUP estimates were obtained for all performing animals and their relatives using the PEST package (G roeneveld and K ovac 1990; G roeneveld et al. 1992). The BLUP estimates of breeding values have a distribution which is approximately normal, and more importantly, the use of all records from all competitions enables a high accuracy to be achieved for horses that have a large number of performances and/or performing relatives. Zusammenfassung Zuchtwerte von Springpferden aus Platzrängen in allen Tournieren Die genetische Bewertung von Springpferden zielt auf ihre Springleistung. Nachdem diese nicht direkt beobachtet werden kann, verwenden traditionelle Berwertungsverfahren verschiedene relative Maße wie Gewinnsummen oder Punktezahlen. Der Nachteil dieser Vorgangsweise liegt darin daß Bewerbe, wo die Pferde nichts gewonnen haben und hiefür keine Korrekturen vortliegen, unberücksichtigt bleiben. Die Zahl der angetretenen Bewerbe und damit die Auswirkung der Gesamtzahl von Bewerben auf die Genauigkeit kann nicht befriedigend in Rechnung gestellt werden. Die hier vorgeschlagene Methode verwendet die gesamte Information von allen Pferden in allen Bewerben zur Schätzung von Varianz‐komponenten für zufällige Wirkungen und BLUP der Zuchtwerte mittels eines Tiermodells. Pferde werden vom ersten bis zum letzten rangiert und Plätze zu normalverteilten Punkten verwandelt, die als Maß der Springleistung anzusehen sind. Wir analysierten 160084 Leistungen von 6786 Pferden in 7313 irischen Bewerben von 1993–1996. Varianzkomponenten für additiv‐genetische, permanente Umwelt‐ und temporäre Umwelteinflüsse wurden mittels REMLVCE (G roeneveld 1994) geschätzt. Heritabilität einer Einzelbewertung war 0.08, Wiederholbarkeit 0.20 und BLUP für Einzelmerkmale wurde für alle Tiere und ihre Verwandten mittels des PEST Programs (G roeneveld und K ovac 1990; G roeneveld et al. 1992) geschätzt. Die BLUP der Zuchtwerte zeigt annähernd normale Verteilung und die Verwendung aller Bewerbe eines Pferdes ergibt hohe Genauigkeit der Beurteilung von Pferden mit vielen Bewerben.

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