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A comparative mapping approach to the pig genome
Author(s) -
Rettenberger G.,
Bruch J.,
Hameister H.
Publication year - 1996
Publication title -
journal of animal breeding and genetics
Language(s) - German
Resource type - Journals
SCImago Journal Rank - 0.689
H-Index - 51
eISSN - 1439-0388
pISSN - 0931-2668
DOI - 10.1111/j.1439-0388.1996.tb00623.x
Subject(s) - synteny , biology , genetics , somatic cell , locus (genetics) , microbiology and biotechnology , genome , fish <actinopterygii> , gene , chromosome , gene mapping , fishery
Summary During these studies an informative somatic cell hybrid mapping panel for the pig genome was established. Over all 93 structural gene loci and porcine specific polymorphic STS markers were assigned to chromosomes by use of this panel. To facilitate the transfer of mapping information from human to pig a ZOO‐FISH analysis with human chromosome specific DNA libraries as hybridization probes was performed. The whole pig karyotype is made up by 48 segments which show homology of synteny with human chromosomes. For certain loci further refinement of localization was obtained by direct FISH localization of locus‐specific DNA probes. Zusammenfassung Vergleichende Genomanalyse heim Schwein Es wurde eine informative Zusammenstellung von somatischen Zellhybriden des Schweines erstellt. Insgesamt wurden mit Hilfe dieser Zellhybride 93 Strukturgenloci und polymorphe STS‐Loci chromosomal zugeordnet. Um die Übertragung der Genkartierungsinformationen vom Menschen zum Schwein zu vereinfachen und zu beschleunigen, wurden im Karyotyp des Schweines die Segmente sichtbar gemacht, die homologue zu den einzelnen menschlichen Chromosomen sind. Der gesamte Karyotyp mit seinen 20 Chromosomen wird aus 48 zum Menschen homologen Segmenten aufgebaut. Das bedeutet eine dreifach höhere Konservierung der Genanordnung als zwischen Mensch und Maus bestimmt. für eine Anzahl von Loci wurde eine weitere Feinkartierung mit locusspezifischen YAC‐DNA‐Proben durch FISH‐Anaylse erreicht.