Comparison of alternative computational procedures in BLUP sire evaluation

Summary The main ideas for implementing BLUP programs were developed when computer possibilities were much more limited. Now, it is possible to improve the programs, fully utilizing the power of modern computers. Three new techniques – modified group equations, HASH storing of coefficients, and an alternative iteration procedure – were applied to sire evaluation using a repeatability model in a dairy cattle population. It was proved that applying new techniques leads to a 3 fold decrease of program length in source form over a program using old design, and running times are reduced from 30 to over 70%. Zusammenfassung Vergleich alternativer Rechenverfahren bei der BLUP‐ Zuchtwertschätzung Die Konzepte der Implementierung von BLUP‐Programmen wurden entwickelt, als die Computer‐Möglichkeiten noch sehr beschränkt waren. Es ist heute möglich, die Programme unter voller Ausnutzung der Leistungsfähigkeit moderner Computer zu verbessern. Drei neue Techniken – modifizierte Gruppengleichungen, HASH‐Speicherung der Koeffizienten und ein alternatives Iterationsverfahren – wurden bei der Zuchtwertschätzung von Bullen nach einem Wiederholbarkeitsmodell angewandt. Es wurde gezeigt, daß die neuen Techniken zu einer Verkürzung der Programme auf ein Drittel der ursprünglichen Länge und zu einer Reduzierung der Laufzeiten um 30 bis 70% führten. Résumé Comparaison de methodes alternatives pour ordinateurs pour l'estimation de la valeur héréditaire moyennant BLUP. Les idées principales de réalisation des programmes BLUP ont été développées lorsque les possibilités «ordinateurs» étaient encore très limitées. Aujourd'hui, il est possible d'améliorer les programmes par l'utilisation totale de la capacité de rendement des ordinateurs modernes. Trois techniques nouvelles – équations modifées des groupes, HASH‐accumulation des coéfficients et un procédé alternatif d'itération – ont été appliquées pour l'estimation de la valeur héréditaire des taureaux en utilisant un modèle de répétabilité. Il est prouvé que l'application de nouvelles techniques mène au raccourcissement des programmes jusqu'à un tiers de la longueur d'origine et à une réduction des délais de 30 à 70%. Resumen Comparación de procedimientos computacionales alternativos en la evaluación de padres a traves de BLUP Los principales ideas en la implementación de BLUP‐programas, fueron desarrolladas aún cuando las posibilidades de computación eran muy límitadas. Ahora, es posible mejorar los programas, utilizando el poder total de los computador tadores modernos. Tres nuevas técnicas – grupos de ecuaciones modificadas, HASH almacenajes de coeficientes y unaalternativo prodecimiento iterativo – fueron aplicados para la evaluación de padres, usando un modelo de repetibilidad en una población de ganado lechero. Se prueba que, aplicando nuevas têcnicas se disminuye hasta en un tercio del largo del programa original y se reduce el tiemempoe ejecución en un 30 hasta un 70%.