Premium
Amplification de séquences (RT‐PCR) et analyse du polymorphisme des fragments de restriction (RFLP) de quelques isolats du Prunus necrotic ringspot ilarvirus
Author(s) -
Boulila M.,
Marrakchi M.
Publication year - 2001
Publication title -
eppo bulletin
Language(s) - French
Resource type - Journals
SCImago Journal Rank - 0.327
H-Index - 36
eISSN - 1365-2338
pISSN - 0250-8052
DOI - 10.1111/j.1365-2338.2001.tb00987.x
Subject(s) - microbiology and biotechnology , biology , restriction fragment length polymorphism , polymerase chain reaction , genetics , gene
L'approche moléculaire basée sur l'usage de l'amplification génique (RT‐PCR) et l'analyse du polymorphisme des fragments de restriction (RFLP) a été utilisée pour la détection et le typage de trois isolats (Peerless, Texas et Khoukhi) du Prunus necrotic ringspot ilarvirus (PNRSV) sévissant dans les vergers et les parcs à bois d'amandier en Tunisie. Une comparaison a été effectuée avec deux autres isolats provenant, en l'occurrence, de France (isolat de cerisier) et d'Italie (isolat d'abricotier). La RT‐PCR a permis de mettre en évidence la présence de ce virus dans le matériel végétal testé en amplifiant une portion génomique de 282 pb localisée sur l'ARN‐3 de ce virus. L'analyse RFLP a permis de distinguer deux groupes d'isolats (Khoukhi et Cerisier, d'une part et Texas et Abricotier, d'autre part). L'isolat Peerless appartient au deux groupes. Un travail antérieur de caractérisation sérologique basée sur l'emploi d'anticorps monoclonaux a permis de conclure à ce que l'analyse RFLP est moins sensible que la sérologie quant à la distinction entre divers isolats de PNRSV. Un travail ultérieur, utilisant le séquençage de produits de PCR, fournirait des informations encore plus précises et détaillées.