检测“食肉菌”的新方法

用于识别患者样本中细菌的传统技术需要在实验室的培养皿中孵育(培养)细菌。新技术需要检测细菌的遗传学“指纹”部分:DNA 或 RNA。这些技术包括通过靶向性宏基因组测序 TM 寻找具有 16S 特异性基因的细菌,或通过非靶向性鸟枪法宏基因组测序 SM 检测所有细菌的所有基因,其中一些可能不是预期的。 坏死性软组织感染 (NSTI) 是严重的细菌感染,可使皮肤、皮下组织和肌肉死亡(坏死),而且常常导致患者死亡,通常由一种以上的细菌(“食肉菌”)合并作用引起。 使用标准技术识别细菌通常不能检测出所有类型的细菌。在供养不佳组织中生长的细菌(厌氧菌)尤其如此。在通过基本的侵入性手术切除所有死亡组织后,了解哪种细菌对选择哪种抗生素至关重要。 这项法国 Créteil 的研究使用 34 名 NSTI 患者的病变和邻近健康组织比较了标准培养法与 TM 和 SM 的性能。 他们发现,SM 在检测细菌范围更广的细菌方面明显优于 TM。在检测严格厌氧菌方面,SM 也优于标准培养法。有糖尿病的 NSTI 患者从 SM 中获益最多。结果进一步表明,邻近健康皮肤和坏死组织之间具有相似的细菌模式。 Linked Article:   Rodriguez et al . Br J Dermatol 2020; 183 :105–113.