Fluorierte Reagenzien in der Strukturproteomik

Abstract Das Gebiet der Strukturproteomik befasst sich mit der umfassenden Kartierung von Proteinstrukturen, mit dem Ziel, die Beziehung zwischen Proteinsequenz, ‐struktur und ‐funktion zu verstehen. Die Kombination aus chemischer Markierung und Massenspektrometrie‐Analytik hat sich zu einem beliebten Ansatz für biologische Fragestellungen in der Strukturproteomik entwickelt. Hierbei sind biokompatible Reagenzien, die Proteine modifizieren, ohne deren höhere Ordnung zu beeinflussen, der Schlüssel zum Erfolg. Fluor ist bestens dafür bekannt, die physikochemischen Eigenschaften von Reagenzien zu verändern, und spielt daher in der Strukturproteomik eine immer bedeutendere Rolle. In diesem Kurzaufsatz beschreiben wir die Verwendung fluorierter Reagenzien im Bereich der Strukturproteomik. Dabei beziehen wir uns auf MS‐basierte Techniken: a) Affinitätsmarkierung b) Aktivitäts‐basiertes Protein‐Profiling (ABPP), c) Protein‐Footprinting sowie d) Protein‐Crosslinking. Unser Ziel ist es, den Stand der Forschung sowie die Entwicklungen und Anwendungen von fluorierten Reagenzien in der Proteinstrukturanalytik zusammenzufassen.