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Zuckerseitige Wechselwirkungen in einem DNA‐RNA‐G‐Quadruplex: Hinweise auf sequentielle C−H⋅⋅⋅O‐Wasserstoffbrücken als Beitrag zur RNA‐Quadruplex‐Faltung
Author(s) -
Dickerhoff Jonathan,
Appel Bettina,
Müller Sabine,
Weisz Klaus
Publication year - 2016
Publication title -
angewandte chemie
Language(s) - German
Resource type - Journals
eISSN - 1521-3757
pISSN - 0044-8249
DOI - 10.1002/ange.201608275
Subject(s) - chemistry , rna , dna , g quadruplex , stereochemistry , microbiology and biotechnology , biology , biochemistry , gene
DNA‐G‐Quadruplexe wurden systematisch an anti‐dG‐Positionen mit einzelnen Riboguanosin‐Bausteinen (rG) modifiziert. Zirkulardichroismus‐ und NMR‐Experimente bestätigen den Erhalt der nativen Quadruplex‐Topologie für den Großteil der DNA‐RNA‐Hybridstrukturen. Veränderungen in der C8‐chemischen Verschiebung von Guanosinen an der 3′‐Seite einer rG‐Substitution im Quadruplex‐Kern legen C8‐H⋅⋅⋅O‐Wasserstoffbrücken mit dem O2′ des C2′‐endo‐Ribonukleotids nahe. Eine geometrische Analyse bekannter, hochaufgelöster Strukturen deutet darauf hin, dass entsprechende Wechselwirkungen ein allgemeineres Merkmal in RNA‐Quadruplexen sind und möglicherweise zur beobachteten Präferenz für parallele Topologien beitragen.