Eine Gesamtproteom‐basierte Auflistung der Hintergrundbinder von Photovernetzern

Affinitäts‐basiertes Protein‐Profiling (AfBPP) wird weithin zur Identifizierung der Zielproteine bioaktiver Moleküle eingesetzt. Sonden, die Photovernetzer wie Benzophenone, Diazirine und Arylazide enthalten, binden nach UV‐Bestrahlung das Molekül irreversibel an dessen Zielprotein. Bisher ist jedoch nur wenig über Photovernetzer‐spezifische Off‐Targets bekannt, was die Zuverlässigkeit der Ergebnisse einschränkt. Hier wurde deshalb der Proteinhintergrund von Photovernetzern mittels Gel‐freier, quantitativer Proteomik bestimmt. Für jede photoreaktive Gruppe wurden die charakteristischen Off‐Targets identifiziert. Um die Bedeutung der Ergebnisse zu verdeutlichen, wurde H8 , ein Inhibitor der Proteinkinase A, mit einer Diazirin‐Einheit modifiziert. Der Vergleich des identifizierten Diazirin‐Hintergrunds mit den erhaltenen Zielproteinen dieser Photosonde lieferte neue Einblicke in deren In‐situ‐Zielproteine. Die Ergebnisse sind wegweisend für die Identifizierung biologisch relevanter Bindungspartner in Experimenten, in denen Photosonden verwendet werden.