Faltung einer RNA‐Haarnadel in der dicht gedrängten Zelle

Eine korrekte und präzise Faltung der Sekundär‐ und Tertiärstruktur ist von entscheidender Bedeutung für die zelluläre Funktionalität von Ribonukleinsäuren (RNA). Faltungsstudien von RNA wurden allerdings überwiegend in vitro durchgeführt, ohne die Möglichkeit solche Experimente in vivo zu validieren. In dieser Arbeit konnten wir die Faltungsstabilität einer RNA‐Haarnadel direkt in lebenden Säugerzellen auflösen. Die Ergebnisse zeigen, dass die Faltungsstabilität innerhalb der Zelle mit der in einer verdünnten physiologischen Pufferlösung vergleichbar ist. Die In‐vitro‐Verwendung von künstlichen Crowding‐Reagentien, mit der Ausnahme vom hochmolekularen PEG, führt hingegen zu einer Destabilisierung der Haarnadel, die aus Oberflächenwechselwirkung und Verminderung der Wasseraktivität resultiert. Ferner ist die Faltungsstabilität der RNA äußerst variabel, sowohl innerhalb einer Zellpopulation als auch auf der subzellulären Ebene des Zellkerns und des Zytoplasmas. Demzufolge unterliegt die RNA im Inneren der Zelle (lokalisierten) stabilisierenden und destabilisierenden Effekten, die im Mittel und im Vergleich zu der verdünnten Pufferlösung nur eine geringfügige Modulation der Faltungsstabilität verursachen.