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Mapping the Population of Protein Conformational Energy Sub‐States from NMR Dipolar Couplings
Author(s) -
Guerry Paul,
Salmon Loïc,
Mollica Luca,
Ortega Roldan JoseLuis,
Markwick Phineus,
van Nuland Nico A. J.,
McCammon J. Andrew,
Blackledge Martin
Publication year - 2013
Publication title -
angewandte chemie
Language(s) - German
Resource type - Journals
eISSN - 1521-3757
pISSN - 0044-8249
DOI - 10.1002/ange.201209669
Subject(s) - chemistry , dipole , physics , nuclear magnetic resonance , organic chemistry
Molekulare Dynamik : Eine allgemeine Methode zur Beschreibung der konformativen Energielandschaften von Proteinen in Lösung auf der Grundlage statistischer Mechanik wird vorgestellt. Die Methode beruht auf der Kombination von dipolaren NMR‐Restkopplungen (RDCs), dem Abtasten des Konformationsraums durch beschleunigte Simulation der molekularen Dynamik und der Auswahl eines Ensembles unter Verwendung einer modellfreien Ensemble‐Interpretation der RDCs (siehe Bild).