Premium
Directional Selection Precedes Conformational Selection in Ubiquitin–UIM Binding
Author(s) -
Long Dong,
Brüschweiler Rafael
Publication year - 2013
Publication title -
angewandte chemie
Language(s) - German
Resource type - Journals
eISSN - 1521-3757
pISSN - 0044-8249
DOI - 10.1002/ange.201208683
Subject(s) - selection (genetic algorithm) , ubiquitin , computer science , computational biology , chemistry , biology , biochemistry , artificial intelligence , gene
Im Frühstadium der molekularen Erkennung von Ubiquitin durch das Ubiquitin‐Wechselwirkungsmotiv (UIM) des Hrs‐Proteins werden Orientierungen, in denen die Bindefläche von Ubiquitin dem UIM zugewandt ist, mit abnehmendem Abstand stärker begünstigt (siehe Diagramm). Auf diesen durch langreichweitige elektrostatische Wechselwirkungen angetriebenen Prozess folgt eine interne Veränderung der Konformationsbesetzung.