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Ligand‐ and pH‐Induced Conformational Changes of RNA Domain Helix 69 Revealed by 2‐Aminopurine Fluorescence
Author(s) -
Sakakibara Yogo,
Abeysirigunawardena Sanjaya C.,
Duc AnneCécile E.,
Dremann Danielle N.,
Chow Christine S.
Publication year - 2012
Publication title -
angewandte chemie
Language(s) - German
Resource type - Journals
eISSN - 1521-3757
pISSN - 0044-8249
DOI - 10.1002/ange.201206000
Subject(s) - paromomycin , helix (gastropod) , chemistry , rna , conformational change , stereochemistry , biology , biochemistry , aminoglycoside , zoology , gastropoda , gene , antibiotics
Schleifenkonformation : Die Schleife der RNA‐Domäne Helix‐69 (H69) wurde mit dem fluoreszierenden Adenin‐Analogon 2‐Aminopurin (2AP) modifiziert, was die je nach den Bedingungen unterschiedlichen Konformationszustände sichtbar machte. Die Verwendung dieser Modell‐RNA zeigt den besonderen Einfluss des Aminoglycosids Neomycin auf die Schleifenkonformation von H69, der sich von dem der strukturell ähnlichen Verbindungen Paromomycin und Gentamicin unterscheidet (siehe Bild).