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2′‐Fluoro RNA Shows Increased Watson–Crick H‐Bonding Strength and Stacking Relative to RNA: Evidence from NMR and Thermodynamic Data
Author(s) -
Patra Amritraj,
Paolillo Michael,
Charisse Klaus,
Manoharan Muthiah,
Rozners Eriks,
Egli Martin
Publication year - 2012
Publication title -
angewandte chemie
Language(s) - German
Resource type - Journals
eISSN - 1521-3757
pISSN - 0044-8249
DOI - 10.1002/ange.201204946
Subject(s) - rna , chemistry , stacking , crystallography , stereochemistry , biochemistry , organic chemistry , gene
F macht stabil : Der Einbau von 2′‐Desoxy‐2′‐fluorribonucleotiden (2′‐F‐RNA) in RNA‐Oligomere erhöht die Stabilität der resultierenden Doppelstränge deutlich. NMR‐Spektroskopie mit nativen (rote Kreise) und 2′‐F‐modifizierten RNA‐Doppelsträngen (schwarze Quadrate) sowie UV‐Schmelzexperimente zeigen, dass die höhere Stabilität für 2′‐F‐RNA im Vergleich zu RNA sowohl auf stärkere Wasserstoffbrücken der Watson‐Crick‐Paare als auch auf eine günstige Basenstapelung zurückgeht.