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Isotope‐Coded Affinity Tags with Tunable Reactivities for Protein Footprinting
Author(s) -
Underbakke Eric S.,
Zhu Yimin,
Kiessling Laura L.
Publication year - 2008
Publication title -
angewandte chemie
Language(s) - German
Resource type - Journals
eISSN - 1521-3757
pISSN - 0044-8249
DOI - 10.1002/ange.200803378
Subject(s) - footprinting , chemistry , computer science , computational biology , library science , combinatorial chemistry , microbiology and biotechnology , biochemistry , biology , gene , transcription factor
Empfindlich : Isotopencodierte Affinitätsmarker (ICATs) sind vielseitige Sonden zur Untersuchung von dynamischen Proteinstrukturen (Footprinting). Um ein effektives Testsystem zu erhalten, wurde eine Serie von ICAT‐Reagentien entworfen (siehe Bild), deren Alkylierungsgeschwindigkeiten fünf Größenordnungen überspannen. Mit ihnen konnte eine beispiellose Auswahl von Cys‐Resten aufgespürt werden, darunter auch solche, die tief im Proteinkern vergraben und an moderat affinen Protein‐Protein‐Wechselwirkungen beteiligt sind.