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O‐Glycoside Orientation Is an Essential Aspect of Base J Recognition by the Kinetoplastid DNA‐Binding Protein JBP1
Author(s) -
Grover Rajesh K.,
Pond Stephanie J. K.,
Cui Qizhi,
Subramaniam Prem,
Case David A.,
Millar David P.,
Wentworth Paul
Publication year - 2007
Publication title -
angewandte chemie
Language(s) - German
Resource type - Journals
eISSN - 1521-3757
pISSN - 0044-8249
DOI - 10.1002/ange.200604635
Subject(s) - dna , chemistry , stereochemistry , computational biology , computer science , microbiology and biotechnology , biochemistry , biology
Ein empfindliches Protein : Der Vergleich der Dissoziationskonstanten und Moleküldynamikschnappschüsse einer Reihe synthetischer telomerer doppelsträngiger DNA‐Sequenzen mit HMdU‐O‐Glycosiden ergab, dass das DNA‐bindende Protein von Kinetoplastiden wie Leishmania und Trypanosoma , JBP1, eine kritische Edge‐on‐Konformation des Pyranosylrings von Base J erkennt. Wenn diese Konformation gestört ist, nimmt die JBP1‐Bindung drastisch ab.
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