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Calculation of the Dependence of Homo‐ and Heteronuclear 3 J and 2 J Scalar Couplings for the Determination of the 2′‐Hydroxy Conformation in RNA
Author(s) -
Fohrer Jörg,
Reinscheid Uwe,
Hennig Mirko,
Carlomagno Teresa
Publication year - 2006
Publication title -
angewandte chemie
Language(s) - German
Resource type - Journals
eISSN - 1521-3757
pISSN - 0044-8249
DOI - 10.1002/ange.200602583
Subject(s) - heteronuclear molecule , chemistry , physics , crystallography , stereochemistry , nuclear magnetic resonance spectroscopy
Höchst wirkungsvoll : Die 2′‐Hydroxygruppe beeinflusst die Struktur‐ und Dynamikeigenschaften von RNA und DNA erheblich und steuert die Hydratation der kleinen RNA‐Furche. Die Konformation dieser Gruppe wurde mithilfe von NOEs sowie von 2 J (C2′,OH2)‐ und 3 J (C1′/C3′/H2′,OH2)‐Kopplungen bei niedriger Temperatur in Wasser ermittelt. Hier wurden Ab‐initio‐Rechnungen für die Ableitung geeigneter Gleichungen vom Karplus‐Typ für die Kopplungen genutzt (siehe Bild).