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Protein Structure Similarity Clustering: Dynamic Treatment of PDB Structures Facilitates Clustering
Author(s) -
Charette Bradley D.,
MacDonald Richard G.,
Wetzel Stefan,
Berkowitz David B.,
Waldmann Herbert
Publication year - 2006
Publication title -
angewandte chemie
Language(s) - German
Resource type - Journals
eISSN - 1521-3757
pISSN - 0044-8249
DOI - 10.1002/ange.200602125
Subject(s) - cluster analysis , protein data bank (rcsb pdb) , similarity (geometry) , computer science , computational biology , chemistry , information retrieval , stereochemistry , biology , artificial intelligence , image (mathematics)
In der Familie : Durch das Einführen des Ligandenandockens, der Moleküldynamik und des VAST‐Algorithmus in das Bündeln von Proteinen ähnlicher Struktur wird der Prozess erheblich rationalisiert und lässt sonst unerkannte Beziehungen zu neuen Proteincluster‐Partnern sichtbar werden. VAST=Vector Alignment Search Tool.