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A Combined Effect of Molecular Electrostatic Potential and N7 Accessibility Explains Sequence‐Dependent Binding of cis ‐[Pt(NH 3 ) 2 (H 2 O) 2 ] 2+ to DNA Duplexes
Author(s) -
MonjardetBas Véronique,
ElizondoRiojas MiguelAngel,
Chottard JeanClaude,
Kozelka Jiří
Publication year - 2002
Publication title -
angewandte chemie
Language(s) - German
Resource type - Journals
eISSN - 1521-3757
pISSN - 0044-8249
DOI - 10.1002/1521-3757(20020816)114:16<3124::aid-ange3124>3.0.co;2-9
Subject(s) - chemistry , van der waals force , stereochemistry , dna , crystallography , molecule , biochemistry , organic chemistry
Der wesentliche Faktor für die sequenzselektive Bindung von Pt‐Komplexen an DNA ist die Zugänglichkeit des N7‐Atoms der Guanin(G)‐Reste. Die beobachteten Geschwindigkeitskonstanten für die Reaktion von cis ‐[Pt(NH 3 ) 2 (H 2 O) 2 ] 2+ mit G‐Resten in verschiedenen DNA‐Sequenzen lassen sich anhand eines mathematischen Modells erklären, das auf dem hier gezeigten Reaktionsschema beruht; dabei hängt K vom molekularen elektrostatischen Potential ab und k vom zugänglichen Teil der Van‐der‐Waals‐Oberfläche von N7.