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Hydrophobic Groups Stabilize the Hydration Shell of 2′‐ O ‐Methylated RNA Duplexes
Author(s) -
Auffinger Pascal,
Westhof Eric
Publication year - 2001
Publication title -
angewandte chemie
Language(s) - German
Resource type - Journals
eISSN - 1521-3757
pISSN - 0044-8249
DOI - 10.1002/1521-3757(20011217)113:24<4784::aid-ange4784>3.0.co;2-f
Subject(s) - chemistry
Einfaches Ersetzen einer 2′‐OH‐ durch eine 2′‐OMe‐Gruppe bewirkt bei bestimmten RNA‐Strukturen eine merkliche Verstärkung wichtiger Solut‐Solvens‐Wechselwirkungen. Moleküldynamiksimulationen enthüllten die Komplexität der mit dem Einbringen hydrophober Gruppen in hydrophile Systeme verbundenen Effekte (im gezeigten 2′‐OMe(GpC)‐Basenpaar ist ein verbrückendes Wassermolekül mit langer Residenzzeit in der kleinen Schleife mit einem Pfeil markiert). Grün=Cytosin‐Gerüst, schwarz=Guanin‐Gerüst, rot=Sauerstoffatome von Wasser und den Carbonylgruppen der kleinen Schleife, blau=Stickstoffatome der kleinen Schleife.