Determination of Clarithromycin Resistance in Helicobacter pylori by Molecular Method

Helicobacter pylori gastrik kronik bakteriyel infeksiyona en sık neden olan bakteridir. Eradikasyonda en sık kullanılan tedavi rejimi proton pompa inhibitörü (PPİ) ile amoksisilin, klaritromisin veya metronidazolü içeren iki antibakteriyel ajanın kombinasyonudur. Klaritromisin, H.pylori eradikasyonunda önerilen birçok tedavi protokolünde yer almaktadır ancak, günümüzde klaritromisin direncinin giderek artması eradikasyon tedavisinin başarı oranını azaltmaktadır. Klaritromisin, antibakteriyel etkisini bakterinin 23 rRNA gen bölgesine bağlanarak göstermektedir. Direnç bakterinin ribozomal komponentindeki 23rRNA peptidil transferaz kodlayan gen bölgesindeki nokta mutasyonlar (A2115G, G2141A, A2141G, A2142G, A2143G, A2144G, A2143C, A2142T, T2717C, T2182C) ile olmaktadır. Dirençten sorumlu olan en sık mutasyonlar A2143G ve A2144G olup bu çalışmada gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) metodu ile bu mutasyonların tespiti amaçlanmıştır. Gastroenteroloji polikliniğine dispeptik şikayetler ile başvuran ve endoskopi yapılması kararlaştırılan 66 kadın, 55 erkek olmak üzere toplam 121 hasta araştırmaya alınmıştır. Hastaların midesinde antrum bölgesinden üç adet biyopsi alınmıştır. Dokudan DNA ekstraksiyonu yapılmıştır. Dokuda PZR yöntemi ile H.pylori pozitif bulunan 78 örnekte gerçek zamanlı PZR yöntemi ile 23S rRNA’daki A2143G ve A2144G nokta mutasyonlarına bağlı klaritromisin direnci araştırılmıştır. Yirmi iki örnekte direnç mutasyonu belirlenmiştir. Beş örnekte 57 ve 65±2oC’de iki pik görülmesi nedeniyle hastaların iki farklı H.pylori suşu ile infekte oldukları düşünülmüştür. Ayrıca beş örnekte 83±2oC pik görülmesine karşın (H.pylori pozitif), 57 ve 65±2oC’de pik belirlenememiştir. Bu nedenle bu beş örnek istatistiksel değerlendirmelere dahil edilmemiştir.