Deux coronavirus entéropathogènes nouvellement identifiés chez le porc sont apparentés a des virus de chauve-souris ou d’oiseaux

Les virus de la gastroentérite transmissible (TGEV) et de la diarrhée épidémique porcine (PEDV) sont responsables de désordres entéritiques sévères, souvent fatals chez les animaux en bas âge. Hautement contagieux, sévissant à l’état enzootique ou épizootique dans nombre de pays éleveurs de porcs, ces virus infligent à la production porcine de lourdes pertes économiques. Tous deux appartiennent au genre Alphacoronavirus (aCoV), et comme plusieurs autres membres, reconnaissent l’aminopeptidase N (APN), abondamment exprimée à la membrane des entérocytes, comme récepteur cellulaire(2). L’interaction entre le récepteur et la protéine de spicule S est un déterminant majeur du tropisme tissulaire des coronavirus mais aussi de leur spécificité d’hôte (Benbacer et al. 1997). Plusieurs variants génétiques du virus TGEV ont donné naissance à des souches de coronavirus respiratoire porcin (PRCV), responsables de troubles respiratoires généralement discrets. Ces variants ont pour trait commun des délétions touchant les gènes codant la protéine S et la protéine non-structurale ORF3, et l’un d’entre eux a réussi une émergence spectaculaire en infectant la quasi-totalité du cheptel porcin européen dans les années 1984 et suivantes (Laude et al. 1998).