A case-control study of two polymorphisms of HIF1A in children with cleft lip/palate and in their mother

Amac: Palatogenez, fetal yasamin erken evrelerinde ortaya cikan metabolik bir olaydir. Raporlar, hipoksinin damak olusumunda ve yukselmesinde ve ayrica dudaklarin fuzyonunda kritik bir durum oldugunu gostermektedir. Cevresel faktorlerin yani sira, genetik faktorlerin hipokside onemli rol oynadigi bilinmektedir. Hucrelerin hipoksiye yol acan oksijen basincindaki degisikliklere cevap verebilme yetenegi, hipoksi ile induklenebilir faktorler (HIF'ler) olarak bilinen bir transkripsiyon faktoru ailesinin aktivasyonuna baglidir. Bu calisma, yarik dudak/damakli cocuklar ve bu cocuklarin annelerinde hipoksi ile induklenebilir faktor 1, alfa alt birimi (HIF1A)'nin iki polimorfizminin dagilimini belirlemek icin yapilmistir. Yontemler: HIF1A'nin (Pro582Ser ve Ala588Thr) iki polimorfik yapisi, calisma grubu olan yarik dudak/damakli cocuklar ve annelerinde ve kontrol grubu cocuklar ve annelerinde polimeraz zincir reaksiyonu fragment uzunlugu polimorfizmi (PCR-RFLP) yontemi kullanilarak incelendi. DNA fragmentleri, kesim isleminden sonar agaroz jelde goruntulendi. Bulgular: Polimorfik yapilardan Ala588Thr karsilastirmasinda, yarik dudak/damakli cocuklar ve anneler ile kontrol grubu cocuklar ve anneleri arasinda fark gozlenmemistir. Pro582Ser karsilastirmasinda ise; anne ve cocuk genotiplerinin kontrol gruplariyla karsilastirilmasinda farkliliklar gorulmustur (P=0.034 ve P=0.023, sirasiyla). Alell karsilastirmalarinda, yarik dudak/damakli cocuklarin anneleri ile kontrol grubu anneleri arasinda fark gozlenmistir (P=0.001). Cocuklardaki allel karsilastirmalarinda da, annelerdeki kadar yuksek olmasa da fark gorulmustur (P=0.026). Sonuc: HIF1A proteinindeki Prolin aminoasitlerinin degisimine neden polimorfizmler, HIF1A proteininin aktivitesini veya omrunu etkiliyor ve yarik dudak/damak olusunda rol aliyor olabilir.