Çanakkale ili börülce üretim alanlarında Hıyar mozaik virüsü (Cucumber mosaic virus; CMV)’nün tespiti ve kılıf protein genine göre moleküler karakterizasyonu

Bu calisma kapsaminda 2015-2016 yillarinda Canakkale ilinin borulce ve fasulye yetistiriciligi yapilan alanlarina arazi cikislari yapilarak virus ve virus benzeri belirtiler gosteren 14 fasulye, 8 borulce olmak uzere toplam 22 bitkiden ornekler alinmistir. Toplanan ornekler Hiyar mozaik virusu ( Cucumber mosaic virus ; CMV) varligini belirlemek icin DAS-ELISA ile testlenmis ve 6 ornek CMV ile enfekteli bulunmustur. Enfekteli bulunan tum ornekler borulce bitkisinden elde edilirken, fasulye bitkilerinde enfeksiyon tespit edilememistir. Elde edilen CMV izolatlarinin kilif protein (CP) gen bolgesi, gen spesifik primerler kullanilarak cogaltilmis ve izolatlarin tamaminda 638 bp buyuklukte CP genine spesifik urun elde edilmistir. CMV izolatlari arasindan CWP17 tesadufi olarak secilerek RT-PCR urunleri purifiye edilmis ve kismi baz dizisi analizi gerceklestirilmistir. CWP17 izolatina ait sekans verisi KY474380 erisim numarasi ile gen bankasina kaydedilmistir. Gerceklestirilen coklu dizi analizleri sonucunda CWP17 izolatinin dunya CMV izolatlari ile nukleotid duzeyinde %80-99, aminoasit duzeyinde ise %90-100 benzerlik gosterdigi saptanmistir. Olusturulan filogenetik agaclar ile de CWP17 izolatinin alt grup IB’de yer aldigi belirlenmistir. Gerceklestirilen bu calisma ile Turkiye’de ilk defa CMV enfeksiyonu ticari borulce uretim alanlarinda tespit edilmistir. Ayrica ulkemizde ilk kez baklagil uretim alanlarinda CMV enfeksiyonunun molekuler karakterizasyonu gerceklestirilmistir.