Mycobacterium tuberculosis suşlarının polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) yöntemi ile genotiplendirilmesi Genotyping mycobacterium tuberculosis strains with polymerase chain reaction (PCR)

Amac: Tuberkuloz, gunumuzde giderek artan bir toplum sagligi sorunu haline gelmistir. Infeksiyon dinamiklerini incelemek ve uygun tedavi ve infeksiyon kontrol stratejileri belirleyebilmek icin etkenin molekuler tiplendirmesi onemlidir. Mycobacterium tuberculosis genotiplemesinde altin standart IS6110 RFLP analizi olmakla birlikte, yontemle ilgili zorluklar nedeniyle son yillarda Polimeraz Zincir Reaksiyonuna (PZR) dayali yontemler de kullanilmaktadir. Bu calismada, akciger tuberkulozlu 39 farkli hastadan izole edilen M. tuberculosis izolatinin, PZR yontemi ile genotiplendirilmesi amaclanmistir. Gerec ve Yontem: Lowenstein-Jensen besiyerinde uretilen suslarin hucre duvarlari cam boncuklarla parcalanarak DNA elde edilmistir. PZR ile genotiplendirme icin, IS6110 insersiyon dizisinin iki ucuna yonelik hazirlanan IS–1 (5’CAA GAA CCT TTC CTA CCC CA 3’) ve IS–2 (5’GGC TGA GGT CTC AGA TCA G 3’) primerleri kullanilmistir. Elde edilen bant paternleri bilgisayar ortamina aktarilarak, suslar arasi genetik yakinlik, Syngene Gene Directory 1.02.0 (Syngene, Cambridge, Ingiltere) programinda UPGMA metodu ile Dice katsayisi kullanilarak belirlenmistir.Bulgular ve Sonuc: Calisma sonucunda izolatlarin hepsinin genotipik olarak birbirinden farkli oldugu tespit edilmis, yontem kolay uygulanabilir, hizli, ucuz ve tekrarlanabilir bulunmustur.