Estratégia Algorítmica para a Reconstrução e Validação da Estrutura Molecular de Variantes do SARS-CoV-2

Aspectos matemático-computacionais e físico-químicos envolvidos na reconstrução da estrutura molecular tridimensional de proteínas do SARS-CoV-2 são abordados neste artigo, envolvendo a variante P.1 detectada em pacientes infectados em solo brasileiro, principalmente as do estado do Amazonas. Foi realizado um estudo sobre o impacto teórico da P.1 por intermédio da reconstrução estrutural de proteínas onde a mutagênese foi realizada computacionalmente e com o auxílio da implementação de um algoritmo de enumeração implícita de factibilidade, Branch-and-Prune, cujas soluções foram validadas através do uso do gráfico de Ramachandran. Desta forma, mesmo com a ausência de estruturas cristalográficas caracterizando estas mutações, pôde-se computacionalmente modelar uma estrutura tridimensional onde ao fim realizou-se o alinhamento estrutural com a cristalografia do complexo ACE2-RBD