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Cada celula no corpo humano deve crescer, reproduzir-se, processar informacoes, responder a estimulos e realizar uma serie consideravel de reacoes quimicas. As celulas sao envolvidas pela membrana celular e preenchidas com uma solucao aquosa concentrada de substâncias quimicas, substâncias fisicas e o citoplasma. O citoplasma e o material celular localizado entre a membrana celular e o nucleo, sendo o local onde se concentra o maior numero de atividades celulares, [1]. Uma molecula de acido desoxirribonucleico (DNA) consiste de duas longas cadeias polipeptidicas compostas por quatro tipos de subunidades nucleotidicas. No caso dos nucleotideos do DNA, o acucar e uma desoxirribose ligada a um unico grupo fosfato, cujas bases sao: adenina (A), citosina (C), guanina (G) ou timina (T). As sequencias codificantes de genes eucarioticos sao caracteristicamente interrompidas por sequencias intervenientes nao-codificantes (introns). Tanto as sequencias de introns quanto de exons sao transcritas em RNA. As sequencias dos introns sao removidas do RNA transcrito por meio de um processo denominado splicing de RNA. Grande parte do splicing de RNA que ocorre nas celulas atua na producao de mRNA, sendo denominado splicing do precursor de mRNA (ou pre-mRNA). Somente apos ter ocorrido o splicing e o processamento das extremidades 5’ e 3’ esse RNA sera denominado mRNA, [2]. O gene Hint-1 do nematoide C. elegans (identificado por ”geneID”numero 184760, no NCBI) e composto por 3 exons e 2 introns com os seguintes comprimentos (em termos de nucleotideos): exon 1 com 123, intron 1 com 44, exon 2 com 138, intron 2 com 74 e exon 3 com 132, totalizando 511 nucleotideos. Este gene foi identificado como uma palavra-codigo de um codigo BCH com parâmetros (511, 502, 3) sobre o anel Z4 com polinomio gerador g(x)  x9  2x7  x5  3, via o algoritmo de geracao de sequencias de DNA proposto em [3]-[5]. A matriz geradora G tem dimensao 502  511. Por outro lado, sabemos do processo de codificacao que a palavra-codigo v (sequencia do gene Hint-1) resulta da seguinte operacao v  u.G. Desse processo temos duas possibilidades de analise. A primeira tem a ver com a caracterizacao das submatrizes associadas aos correspondentes exons e introns do gene Hint-1 e suas relacoes. A segunda tem a ver com as componentes do vetor u, que chamaremos vetor de sinalizacao. Sob o ponto de vista do vetor sinalizacao, notamos que existem componentes deste vetor que sao comuns tanto a exons como a introns, mostrando uma forte ligacao na regiao de fronteira. Uma interpretacao biologica que fazemos do vetor sinalizacao u e a de realizar a localizacao/identificacao no DNA da sequencia precursora do RNA, pre-RNA. O proximo passo e a obtencao do mRNA associado ao correspondente gene. Para isso, e necessario que o mecanismo de splicing do pre-mRNA entre em acao. Isto por sua vez implica que a maquinaria de splicing deve reconhecer tres regioes na molecula precursora Bolsista de Mestrado - CAPES †Pesquisa com suporte financeiro do CNPq e FAPESP do RNA: a regiao de splicing 5’, a regiao de splicing 3’ e o ponto da forquilha na sequencia do intron que forma a base do fragmento em laco a ser excisado. Cada um desses tres sitios tem uma sequencia nucleotidica consenso, que e similar entre os introns e que fornece a posicao onde deve ocorrer o splicing. Sob o ponto de vista da matriz geradora G, o espaco vetorial gerado tem dimensao 502. Todavia, as dimensoes dos subespacos correspondentes aos exon 1, intron 1, exon 2, intron 2, e exon 3 apresentam os seguintes valores 123, 53, 147, 83, 132. Note que a soma dessas dimensoes vale 538, portanto ultrapassando o valor 502. Isso implica que o espaco total nao e uma soma direta dos correspondentes subespacos. Mais ainda, estabelece uma dependencia entre os subespacos vizinhos. Essa dependencia entre subespacos vizinhos nada mais e que uma memoria associada. Biologicamente podemos inferir que um intron estabelece um processo de ”amarramento”entre os exons subsequentes e que se mostram importantes tanto no aspecto da realizacao do splicing alternativo como no da confiabilidade. Ambos processos de vital importância para a conservacao da especie. A quantidade de proteinas decorrentes do realizacao do processo de splicing alternativo do gene Hint-1, as isoformas e suas relacoes bem como as analises de ”insercao”e ”delecao”de nucleotideos nos limiares dos pares exon-intron e intron-exon serao apresentadas tendo como base a utilizacao dos codigos de Tenengolts, [6].

Análise do splicing alternativo do Gene Hint-1 através do código BCH associado